Biochimica generale e metabolismo
Scopo
Il gruppo lavora nell'ambito della biochimica generale e del metabolismo. Si distingue per un approccio di biochimica analitica quantitativa rigorosa integrata sia con tecniche di biofisica avanzata che con approcci computazionali.
L'interesse principale è rivolto allo studio dei meccanismi alla base della regolazione redox e della loro relazione con la vita e la morte delle cellule. Particolare attenzione viene data al ruolo della nutrizione e delle glutatione perossidasi, un gruppo di enzimi omologhi che controllano gli idroperossidi prodotti durante il metabolismo. Vengono utilizzate entrambe le tecniche biofisiche e biochimiche. Polarografia, Risonanza Magnetica Nucleare (NMR), Surface Plasmon Resonance (SPR), proteomica, lipidomica, chimica delle proteine ed enzimologia, integrate con biologia molecolare e bioinformatica, vengono applicate per raggiungere l'obiettivo. Il nostro approccio mira a razionalizzare complessi fenomeni biologici sfruttando gli strumenti precisi di chimica, fisica e biochimica.
Ambiti/Linee di ricerca
- Analisi biochimiche e biofisiche su glutatione perossidasi (GPx) e altri bersagli specifici nella ferroptosi
- Proteomica target: studi dettagliati di proteine con tecnologie basate su spettrometria di massa ed enzimologici
- Predizione di funzione proteica in silico
- Analisi delle strutture non canoniche del DNA
- Strategie alternative per il ripristino funzionale del F508del-CFTR: nuovi target per lo sviluppo di farmaci contro la fibrosi cistica
- Studi cinetici e di docking degli inibitori delle monoamino ossidasi
Attività
- Analisi di spettrometria di massa: proteomica e lipidomica
- Caratterizzazione del profilo metabolomico (di fluidi biologici in condizioni normali e patologici) mediante 1H-NMR
- Caratterizzazione delle interazioni biomolecolari (proteina-proteina, lipidi e membrana-proteina, piccoli composti organici-proteine e oligonucleotidi) in termini di cinetica e affinità mediante il sistema SPR legante in tempo reale (Surface Plasmon Resonance)
- Analisi bioinformatica di dati omici
- Sviluppo e studio razionale di molecole attive su target molecolari con tecniche di drug design
Sede
Sede di Chimica Biologica
viale G. Colombo, 3 35121 Padova (Italia)
Tel +390498276104
Fax +390498073310
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Responsabile
- Prof.ssa Matilde Maiorino
Staff/Persone
- Prof.ssa Anna Maria Brunati
- Prof. Stefano Toppo
- Prof. Giorgio Cozza
- Prof.ssa Antonella Roveri
- Dott.ssa Valentina Bosello-Travain
- Prof. Giovanni Miotto
- Dott. Lucio Zennaro
- Dott.ssa Maria Luisa Di Paolo