Sono Professore Ordinario di Bioingegneria Industriale presso il Dipartimento di Medicina Molecolare dell'Università di Padova dove svolgo attività di ricerca nel campo della bioinformatica traslazionale. Il mio lavoro di ricerca si colloca all’intersezione tra ingegneria, biologia e medicina, con particolare attenzione allo sviluppo di modelli computazionali e metodi di integrazione dei dati per applicazioni nella medicina di precisione. Nella mia ricerca sviluppo e applico approcci di biologia computazionale per l’interpretazione di dati multi-omici nell’abito dell’epigenomica, dell’organizzazione tridimensionale del genoma e della genomica a singola cellula.
I miei studi mirano a comprendere i meccanismi molecolari alla base di patologie complesse, tra cui tumori, malattie del sistema immunitario e disturbi neurologici con l’obiettivo di identificare biomarcatori, target terapeutici e possibili strategie di trattamento personalizzato attraverso l’integrazione di dati genomici, trascrittomici, epigenetici e proteomici.
Ha partecipato e coordinato progetti di ricerca nazionali e internazionali finanziati da programmi come Horizon Europe, H2020, il Consiglio Europeo della Ricerca (ERC), l’Associazione Italiana per la Ricerca sul Cancro (AIRC), i PRIN e il Piano Nazionale di Ripresa e Resilienza (PNRR). Coordino un’unità di bioinformatica a supporto della ricerca sperimentale e clinica, fornendo servizi di analisi dati, sviluppo di pipeline e strumenti di modellizzazione. Il mio gruppo di ricerca ha realizzato diversi software e database open-source utilizzati a livello internazionale.
Sono autore di oltre 200 pubblicazioni scientifiche, comprese numerose uscite su riviste di riferimento nei settori della genomica, della biologia computazionale e della scienza dei dati biomedici. Sono stato relatore in conferenze internazionali e membro di comitati scientifici e redazionali.
Ho svolto attività di ricerca in istituzioni estere e mantengo collaborazioni con università ed enti di ricerca nazionali e internazionali in progetti che vanno dallo sviluppo di modelli predittivi per la medicina personalizzata all’esplorazione di nuove strategie terapeutiche basate su analisi integrata dei dati.
All'interno del Dipartimento contribuisco allo sviluppo di infrastrutture di ricerca, programmi formativi e attività interdisciplinari che collegano bioingegneria, genomica e medicina traslazionale, con l’intento di supportare l’innovazione nel campo biomedico a livello nazionale e internazionale.

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L'elenco completo delle pubblicazioni è disponibile su PubMed MyBibliography: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/myncbi/1T7KaQCI9gr/bibliography/public/

Progettazione e applicazione di metodi di biologia computazionale e bioinformatica per organizzare, analizzare, confrontare, interpretare e visualizzare dati -omici.
Dal punto di vista metodologico, le linee di ricerca attuali comprendono lo sviluppo di metodi, risorse e strumenti computazionali per: i) l'analisi integrata di dati multi-omici e fenotipici; ii) l'epigenomica e e lo studio della struttura 3D della cromatina; iii) la modella zione di sistemi biologici complessi; iv) la genomica a singola cellula e la genomica spaziale a singola cellula.
Dal punto di vista applicativo, il mio gruppo supporta biologi sperimentali in istituzioni di ricerca nazionali e internazionali nello studio delle basi genomiche di sistemi biologici complessi, con particolare enfasi sull’oncogenomica, l’immunogenomica e le neuroscienze.