Core Facilities di riferimento

Analitica biochimica-biofisica; tecnologie omiche e computazionali

Analisi Genetica, Genomica e Bioinformatica

Scopo

Il nostro gruppo è coinvolto in ogni aspetto dell'analisi bioinformatica che va dai dati NGS alla funzione delle proteine e loro struttura.

Ambiti/Linee di ricerca

Il campo di ricerca è in bioinformatica ed in particolare:

• progettazione e gestione di banche dati per progetti Genomici high-throughput
• Analisi di dati di spettrometria di massa
• Predizione di funzione delle proteine ed ontologia
• Molecular modelling (fold recognition e comparative modelling)
• Studi su famiglie di proteine, in particolare le glutatione perossidasi, analisi di dati RNAseq
• Analisi delle strutture non canoniche del DNA

Attività

Genomici high-throughput

Analisi di dati di spettrometria di massa

Predizione di funzione delle proteine ed ontologia

Molecular modelling (fold recognition e comparative modelling)

Studi su famiglie di proteine, in particolare le glutatione perossidasi analisi di dati RNAseq

Collaborazioni

• Dr. Paolo Fontana Edmund Mach Foundation (FEM) San Michele All'Adige
• Prof. Antonino Polimeno e Prof.ssa. Laura Orian Dipartimento di Scienze Chimiche, Università di Padova
• Prof.ssa. Barbara Di Camillo, Department of Information Engineering, University of Padova

Sede

Sede di Chimica Biologica
viale G. Colombo 3, 35131 Padova, Italy
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Responsabile

Prof. Stefano Toppo

Staff/Persone

• Dr. Enrico Lavezzo
• Dr. Michele Berselli